Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中微生物表观遗传标记的存在

2021-12-27 00:00:45 来源:
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导言:在一时期阶段,有机物就开始了在不改变细菌细胞内DNA组织顺序的在此之前提下去使其DNA发挥各有不同的功能性,而这就是通过给DNA亚基上添加化学上标来意味着的。DNA酮化是灵长目的不可或缺密切相关表现型机制,其中会5-酮胞嘧啶(5mc)是最典型的DNA;也之一。6mdA是细菌限制普遍性;也系统会的基本组成成分,目在此之前在灵长目中会缺乏已知的限制普遍性;也系统会。此在此之前有不少研究课题报道,6mdA也实际上于灵长目中会,但并无证据支持。

近日,在《科学研究课题进展》上的一项研究课题中会,瑞典林雪平大学的研究课题医护人员表明,灵长目细胞内中会实际上细菌密切相关表现型上标很可能被污染源了,并且未曾足够的证据来断定灵长目中会实际上这种;也。

N6-酮腺嘌呤(6mdA)是细菌中会广泛的DNA;也,但最近在灵长目DNA中会也得到了举例来说。然而,研究课题医护人员说道,即使对来自相同灵长目细胞内子类的DNA进行的6mdA其所和丰度测定研究课题也不一致。

为了再进一步阐明6mdA在灵长目由此可知规格中会的作用,研究课题医护人员透过了体外将人类文明幼稚T特别设计(NTH)细胞内分化为TH细胞内亚群的能力。但是,与此在此之前的研究课题显然,他们断定TH分化过程中会6mdA的丰度未曾仅有局变化,并且注意到到分化的T细胞内中会的6mdA低水平与未酮化的仅有高通量扩增DNA相同,这表明6mdA未曾以可检测的低水平实际上人类文明T细胞内中会。

他们还分析了从六个人类文明细胞内系中会分离出的DNA中会的6mdA,并鉴别出两个不具高于背景增益低水平的6mdA低水平的细胞内系。出乎意料的是,两种单独的293T细胞内系培养物不具各有不同的6mdA低水平,这表明研究课题医护人员注意到到的6mdA信号并非细胞内子类本身固有的。确实,当他们再进一步看时,他们断定两条6mdA低水平升高的细胞内系被变形虫旧称污染源,变形虫旧称一种典型的细菌细胞内培养物中会富含6mdA的二恶英。当他们用变形虫特异普遍性抗生素Plasmocin处理细胞内系时,6mdA信号降低为A阴普遍性对照。

“我们意识到通过这些新科技检测到的6mdA'信号'只是增益。但是,由于一些简单的新科技问题,几种方法中会的背景增益不是随机的,而是真实信号。”高级所作Colm Nestor(科尔姆·内斯特)在一份新闻稿中会说。

研究课题医护人员分析了以在此之前通过DNA免疫沉淀高通量、质谱和单分子实时高通量在灵长目细胞内中会相对于或检测6mdA的努力。人们断定每种方法都有局限普遍性或缺陷,使密切相关表现型上标的假阳普遍性断定率很高,显然表明林雪平研究课题医护人员显然不实际上这种自然现象的证据。

这组所作说道:“我们断定,RNA和细菌污染源、抗体交叉反应普遍性和其他新科技限制的结合已引发6mdA在灵长目DNA中会的反复误判比对。随着DNA和RNA;也家族的大幅度下降,以及以在此之前未知;也的丰富普遍性愈来愈稀有,即使可用多种二者之间方法,我们也强调了误判断定的可能普遍性。我们建议可用;也和未;也的高通量DNA标准作为现阶段对稀有DNA;也的研究课题的最低要求,以及在可用在此之前不够仅有面地验证抗体特异普遍性。”

内斯特补充说,研究课题医护人员在研究课题非常稀有的自然现象时需要非常用力,选择可用哪种方法,并考虑他们是不是无论如何在衡量实际上的事物。他说:“从在此之前我们可以毫无疑问地说灵长目中会不实际上6mdA。关于6mdA,如果研究课题医护人员停止研究课题根本不实际上的东西,则可以节省大量时间段和金钱,并且可能会了很多令人震惊满意的什么事。”

重构出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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